Yorksite

几年前把手表从卡西欧小方块换成了 Apple Watch S7，当时坚持闭上运动圆环、每天早上看看自己睡眠质量如何。然而几年时间过去后，发现自己已经不太在意这些参数了。虽然天天充电早已经习惯了，但偶尔遇到出差还要专门给手表带充电线，总感觉不太爽利。愈发想念之前踏实可靠的卡西欧，但作为一个手机常年静音的人，非常需要手表/手环带来的来电和消息提醒。卡西欧虽然也有心率方块，但看网上的评价消息提醒不太及时，就作罢了。前一阵买了个佳明 255，用着也不错，续航也好，但佳明在 iOS 上的 App 完全不能进行精细一点的消息推送设置，只能跟随系统。我之前用苹果表时，手机上大部分应用的消息提醒是关闭的，少部分应用开提醒但不推送到手表，只有部分im和todo应用推送到手表提醒。然而佳明的 iOS 应用并不支持根据应用设置是否推送，消息震动也只能选开或者关，因为太烦关了震动后，提醒几乎处在一个不存在的状态。 今年三月，得知 Pebble 复活时，当即预订了明年年初的 Pebble Time 2。克制的功能+长续航+漂亮的表盘，真的是非常戳中我。然而因为一开始订的 Duo 2 退掉了，最近有些迫不及待，闲鱼上观望了一阵，收了台初代的 Pebble Steel。 虽然是十年前的设备，但闲鱼上的卖家帮我换了电池，在十年后的今天还能有一周左右的续航，再想想这几年连续挤牙膏 Apple Watch，真是不争气啊！前一阵和 Dayu 感慨，哪怕新的苹果表有更好的能效，更大的电池，估计也会被更强的系统动画效果给消耗掉，还是得一天一充。 不过这个老 Pebble Steel 自带的表带实在有些惨不忍睹了，想买条 22 mm 标准表带换上，发现表盘的接口不是普通的 22 mm，搜了一下说需要一个专门的表带连接器，这都2025年了，这东西上哪找去。 还好在网上找到了有人做的 Pebble Steel 22mm band adapter 模型，可以装在原本的表盘上，再延伸出一个 22 mm 表带接口。感谢这位名为 Luno 网友在多年前的无私分享，下载模型去嘉立创打印了个接头，耗时三天连运费 12.94 元，装在表上严丝合缝。虽然表体变长了点，但总算是能方便地买到兼容的表带了。 Pebble 有个好玩的点就是各种用户自制的表盘，我也自己做了俩，一个能够在手表内计算下次日出日落的时间并显示在上面，另一个是命运石之门主题的，咱就是说还得是二次元这块。 另一个我手表用到比较多的功能就是计时器，做实验经常会要倒数个十分钟二十分钟的，苹果手表确实方便，佳明就不太行，要选半天才能找到计时器，再按半天才能设置好。Pebble 可以自己在社区应用商店里装 Timer 应用，并且支持把上/下键的长按设为快速启动，爽得很。 总之目前一周多用下来非常满意，更加期待明年年初的 Pebble Time 2 了。

趁着 TGA 还没有开始，盘点一下今年让我玩得非常快乐的那些游戏。本文分成两部分，第一部分是今年发售的游戏，第二部分是往年发售但今年玩得非常快乐的游戏。 吃饭要趁早 如果一款游戏趁刚发售就玩，讨论度和热度都足够高，那种仿佛全世界都在玩的热闹氛围让人着迷。 双影奇境，如果盘点有排名，我愿意把双影排第一，电影化演出+双人配合+不严格的死亡惩罚，虽然部分关卡对平时不玩游戏的人来说强度稍高，但不行还能换手嘛。能和平时不玩游戏的朋友一起体验游戏乐趣，就低门槛高体验而言，实在是玩一个少一个的佳作。 非生物因素，之前 EA 今年发售，也能算是今年的吧。独乐乐不如众乐乐，多人合作也让部分惊悚要素变得不那么吓人，游戏后期设计没有前期那么精巧，但还是让我能和朋友们度过足够快乐的几十小时。是EA玩通过正式版让人还能想玩的游戏，非常难得。 33号远征队，足够惊喜的游戏，在我这属于瑕不掩瑜那档，能让玩不来动作游戏的我体验到和怪一来一回过招的爽快感。剧情上面我倒觉得无功无过，前期谜语人最后把故事挑明，原来是家庭伦理剧。少数缺点大概就是地图设计和引导略微缺失，以及后期数值比较崩坏吧。 哈迪斯2，这就属于那种 EA 期间玩了二十多个小时，正式版出来至今还没有打开的动力。出于对 Supergiant Games 的喜爱，还是将它放在这里，估计将来某个时候会打开来仔细玩玩新增内容吧。 空轨 1st，不得不说，老游戏重制版要是都有这个质量，那每个都卖全新游戏的价格是一点没得挑。画面和战斗都很不错，唯一的缺点大概就是有老 JRPG 剧情的拖沓，不过也是瑕不掩瑜那档。 咚奇刚，人称小马里奥奥德赛，确实好玩但是非剧情驱动的游戏，总还是不太有继续玩下去的动力。玩得不多，希望某天能打完（说实话奥德赛至今也没打完。 梦之形，几年前 demo 就玩了十个小时，一直非常期待，经历了延期终于今年玩到了。轴侧视角类似 moba 的动作肉鸽，主打一个技能和强化宝石的自由组合，玩久了套路有点固定，但这时候也已经爽玩快四十个小时了，和朋友联机其乐无穷。 鸭科夫，年轻人的第一款搜打撤，确实能体会到塔科夫类型游戏的乐趣，门槛也不那么高，要是能联机就更快乐了。虽然有 mod 能用，但是还是希望哪天能出个官方联机，和朋友们再打一次。 BALL x PIT，弹珠台幸存者，玩 demo 就很喜欢，正式版一样也爽爽玩了快二十个小时一周目通关，纯爽快。 好饭不怕晚 虽然今年有很多好游戏，但是这两年发现经过时间积淀的老游戏才更好玩啊！ 神之天平，玩了才知道那么多人说这个游戏被画面耽误了是一点不错，披着 JPRG 外皮的刷子游戏，十分上头，几十个小时转眼就过去了。剧情也还算是吸引人，属于是每个时代人都有属于自己的超时空之钥。 魔法使之夜，不像fsn宏大，不像月姬的纠葛，是玩着就会让人感觉内心平静的作品，很像读《雪国》时的感觉。最近忍不住又开始玩一遍，只要听着音乐就仿佛回到了那个平淡的冬日故事中。 FSN，今年体会到了型月的魅力，把几个经典作品都玩了一遍，都是纯粹靠剧情就能吸引人玩几十个小时的游戏。Fate 系列早有所耳闻，但一直以来对圣杯战争啊、圆桌骑士之类历史色彩很重的故事没什么兴趣，今年玩了就一口气打完，果然又是个少男遇到少女的故事，真好啊蘑菇真有你的。真好啊真好，几乎每个人物都得到了充分的塑造，要是只用一个词来形容，就是“华丽退场”吧。 月姬 R，公主线打完：居然是纯爱！很久没看过这么纯的纯爱了。打完学姐线：果然在极致的混乱和暴力间隙，才更能体现出温馨日常的美好。在人物间对话可以明显感觉到还有很多伏笔没有解释清楚，很多人物也还没有塑造完，不知道里线重制版什么时候出。 P4G，大概是 P 系列最平凡而温暖的校园生活了吧，队友不像 P5 都是些人中龙凤，反而更像是真正身边普通且有自己喜怒哀乐的同学，也会有喜欢和不喜欢的社群。就像生活不会完美，高中生活也肯定有遗憾，这也让 P4 的日常更加轻松真实。P4 的重制版也公布了消息，但那个宣传片实在是……希望到时候做出来能卖相好一点。 逆转裁判 1，久闻逆转裁判系列大名，今年因为 iOS 上的 Delta 模拟器尝试了 GBA 版本，让我这个对律政完全不感兴趣的人都玩进去了。剧本写得很有意思，人物刻画也足够有个性，不过后续作品还没开始玩。 浪漫沙加 2 重制版，各种引导都很优秀了，但当时刚玩完 33 号以至于觉得普通的回合制还是有些平淡。中后段重复性有点高，不过作为重制版游戏很精良了。 密特罗德 生存恐惧，玩的时候明显能感到不管是地图还是技能设计都非常老道，人物性能够强，地图连通性、每次获得新能力后到达下一个区域的隐形引导也非常好。包括地图中会有明显供老手在足够熟悉地图后能达成的速通/破序设计，速通应该也是观赏性极佳。各种boss设计，要用一个词来形容就是“礼貌”，初见会感觉有点难，但经历几次试错之后，大部分怪都能几乎无伤打过。总而言之，不愧是 Metroidvania 中最经典的 metroid 部分，多年过去依旧是标杆。 胧村正，是我十年前就想玩的游戏，借着上半年买了台二手 PSV 的机会给打通了。香草社的美术实在没的说，玩法是经典的清版过关，中后期重复度有点高，但这类型不就主打一个爽快。 改天再盘点一下今年买的满意的各种玩意，上班疲惫实在是让人老想消费。 ...

新利查西菜馆，看名字就是那种老上海西餐。由于离得不远，在过去几年里曾天天路过这家店，感觉店里人一直不多，因此从来没想尝试过。今天心血来潮过来吃了个午饭，一进店发现其他两桌平均年龄估计都得70+，很符合我对这店的印象。 老克勒土豆沙拉 土豆沙拉好像也算是这边比较经典的洋气菜，土豆泥+火腿+鸡蛋+青豆+玉米粒+苹果+千岛酱，吃起来就是看起来的味道。特点是苹果不是块，而是事先和沙拉酱、部分土豆、部分鸡蛋打成酱，再和各种其他组分拌起来，不会有明显的苹果脆口，让口感更加一致的同时又有苹果香来解腻。 金牌葡国鸡 底下是奶油、鸡腿肉，上面是鸡蛋羹的质感，不知道是先蒸后烤，还是纯烤熟的，最顶上有一层烤过才有的鸡蛋外皮，很漂亮，吃起来也很浓郁，还能吃出奶油鸡腿肉里有黑胡椒香味。 吉利猪排 猪排比较嫩，但整体就无功无过吧，调味偏淡需要蘸辣酱油吃，主要是吃到这有点吃不下了。

很长时间里，我追踪新发表文章的方式是用RSS订阅几个感兴趣的期刊网站，每天午休的时候去翻一翻，看有没有感兴趣的，同时也订阅了一些公众号，遇到感兴趣的文章推送就丢进稍后读列表。然而这一流程有几个比较膈应的点，一方面，RSS订阅对于专业领域内的期刊，其中能遇到自己感兴趣文章的概率较高，但是对于综合类期刊（比如CNS），大部分文章跨专业太远了，订阅其RSS大部分推送都是自己不感兴趣的；另一方面，专业相关的大文章公众号一般会发，但有些非国内作者或是中小文章，则很难见到推送，并且公众号的推荐排序真的是一言难尽。 因此，很希望能有更加贴合我阅读兴趣的文章追踪方式。也曾经想过靠关键词过滤等方式筛选，但关键词硬性匹配很容易过于严格，并且维护一份关键词库也绝非易事。前几年LLM兴盛后，动过一些靠AI来追踪文献的念头，但也没想好怎么合适地告知AI我的兴趣所在，并且将大量文章直接丢给AI进行筛选，每天消耗的token估计也少不了。 前些天偶然想到，既然我这几年已经在文献管理工具Zotero里积累了大量阅读过的文献，实际就应该以这些文献为种子，生成一份我的兴趣画像，然后再用这份画像去追踪文献。于是在用codex捣鼓了几天后，做了个脚本，这里暂且将其命名为ZotWatcher。下图为其在News Explorer中的订阅效果。 实现逻辑 太长不看：ZotWatcher会利用Zotero数据库中已有文章的信息，生成一份文献兴趣索引，再将每天运行时新发表的文章与索引进行比对，找到与已有兴趣打分较高的文章作为候选文章，生成RSS供我订阅。 详细版本 获取Zotero文献库：首先通过Zotero API获取个人积累的文献数据库，只是标题、摘要等文献元数据的话，Zotero并不限制储存容量。 构建文献信息索引：将读取到的文献元数据，通过TextVectorizer进行向量化，构建FAISS索引，同时生成一份概要统计文献，包含高频出现的期刊、作者等信息。 抓取候选文章：目前启用了Crossref、arXiv、bioRxiv/medRxiv的API作为新发表文章的来源，同时会根据统计到的高频期刊进行补充抓取。后续可能会加上Altmetric的热门文献。 文献打分：首先利用FAISS检索新获取文献与已有数据库的相似度，同时结合ScimagoJR的期刊SJR质量、时效性、作者等进行加权打分。 文献过滤：根据打分和指定的输出文献数量（默认是20，避免overwhelming），同时筛选只保留近七天内的文章、限制预印本比例不超过30%，获得最终输出。 RSS生成：将候选文章整理成RSS格式，使用GitHub Actions每天早上6点运行，并把运行结果以GitHub Pages形式发布方便使用其他软件订阅。 如果你也想试试 本仓库地址为：ZotWatch 可以Clone或Fork后，需要在设置中配置几项必要信息，例如自己的ZOTERO_API_KEY与ZOTERO_USER_ID等，这些信息的获取方式请见README页面，这里就不赘述了。 每次检测到git push行为或次日六点后该仓库会自动运行，并生成结果。需要留意直接给出的GitHub Pages地址如果打不开，需要在末尾加上/feed.xml（因为没有生成对应的index页面，直接访问可能打不开）。

docker 系列的镜像国内直连不了，真是太费劲了。

整理了下Mac里常用的各种软件，发现乱七八糟还真不少。

模拟转转移到psv实机。

记录一下如何在SnapGene中为一段基因组序列，添加多个不同外显子/CDS的完整结构。 这里以拟南芥的序列为例，比方说选择这个由三个外显子（三段CDS）组成的AT4G10310(HKT1)。 首先下载该区域的全长基因组序列，这里简单起见就直接下载TAIR上的，也可以下载别处带有启动子等额外信息的序列，该序列在Sequences部分的full length genomic。 点击进入后在序列底部有Copy Sequence按钮，点击复制序列。 打开SnapGene，选择 New DNA or RNA File，贴入刚刚的序列，选择线性DNA并输入文件名，点击OK确认。 接下来后退页面回到Sequences处，点击full length CDS，进入并复制全长的CDS序列（或者cDNA，按需要来），并到SnapGene中点击左侧的序列比对，将刚刚的CDS序列与基因组序列进行比对。 此时在Map界面能看到CDS的部分比对到了基因组上，内含子区域显示为空缺。 之后点击底部的Sequence，切换到序列面板，从第一个开始比对上的位置（ATG）开始选中序列，一直拖动直到选中最后一个比对上的位置（终止密码子TAA），在顶部点选Feature-Add Feature。 在弹出窗口中随意输入Feature名称（这里我输入了CDS），并在Type处为序列类型选择为CDS，点击OK进行创建。 这样得到的是没有区分出内含子区域的结构，接下来我们为其拆分出内含子。 在序列比对的Sequence界面，从第一个内含子的起始到第一个内含子结束选中序列，再去Feature菜单中选择Create Feature Segment，弹出界面中就会将完整的结构按选中位置进行拆分。 再点击选中内含子区域的片段，按右侧的删除片段，即可创建第一个内含子，重复此过程直到所有内含子都添加完成。 最后构选上Translate this feature in Sequence view，即可将序列按照CDS翻译为氨基酸序列。 记得保存得到的文件，就完成了。

希望我不是最后一个知道的。

最近太忙了，半个多月前就打完了草稿，但一直没空更新，趁偷闲更新一下。 iPad mini A17 Pro 赶上国补的85折买的，首发破发的苹果还得是国补。虽然是不用加400就能上air的价格，但早就想买个mini日常娱乐用。到手后又配了大康的膜和咸鱼淘的微瑕紫色双面夹，发现不如橙色的亮眼，有些后悔，还是今年新出的紫色更好看。贴膜后屏幕摸起来不再涩涩的，也不担心丢在桌子柜子上刮到机器了。非常满意，几乎每天回到家就捧着它。现在每天白天看屏幕的时间太久了，回家看手机的时候总会觉得屏幕太小，很疲惫，mini的大小就刚刚好，既够大，又不至于大到不想捧着它。大部分时候我拿它看看b站的视频，或是看会儿直播（之前只用手机就不太会看直播，看屏幕久了太累了）。同时，用mini看微信读书也非常舒适，之前曾经在手机上用过，但那个屏幕太小，读书总不太得劲，宁可去用kindle看。我一直觉得看书这种事，偶尔导入一下书，其他时候只用kindle也不大麻烦，但现在发现用起来方便真的太重要了，能极大促进我拿起来读书的欲望，甚至让我第一次去充了个微信读书会员。 caldigit TS3 plus雷电拓展坞 不知道是最近压力大还是双十一前后，购物欲望老强了，新的Mac mini M4也让人看着就心动。然而我的M2 16+512才买一年多，用着也没啥不妥，纠结之下就没买新的Mac mini。于是寻思着买点其他的给自己一点快乐，某天突然想到我的Mac mini的HDMI接口可能是有点松垮，加上经常会去机器上插拔优盘等，于是老会碰到HDMI线，让屏幕黑屏，这时候就要重新去动一动那个线，并且此趋势近期有愈演愈烈的倾向，便打算买个扩展坞。既然要买，准备买个雷电接口的，可那时去看群友挂在闲鱼上的品相价格俱佳的TS4已经被卖掉了，搜了搜有洋垃圾plugable实在不咋好看，就降了降六百多收了个闲鱼上的TS3 plus。Caldigit的这几个扩展坞还都是DP的接口，相比HDMI接口也更稳固一些。虽然旧的这款是DP 1.2的，好在接我4K 60 hz的旧LG显示器也完全足够了。顺便收拾了一下桌子，把Mac mini放在升降台下，扩展坞放在升降台上，插拔优盘很方便，也不再会黑屏了。把我之前的一个爱国者固态也长期插在扩展坞上，休眠或重启后也不会断连，美中不足是扩展坞老是温温的，不知道夏天会不会太热。